| メール | harada.ayaka.gw@u.tsukuba.ac.jp |
| 名前 | 原田 彩佳 |
| 所属(教員組織)※学生は指導教員の所属を選択 /Affiliation (Faculty/Organization) | 生存ダイナミクス研究センター/Center for Dynamic Living Systems |
| 専門分野/ Research Field | 構造生物学 |
| 以下の項目から選んでください。 Please select from the options below. | 教員・研究員/ Faculty Member / Researcher |
| 職位 Position | 助教 |
| 2-1研究へのAIの活用経験と意識(当てはまるものを選んでください)/Experience with and Perceptions of AI Utilization in Research | AIを活用してみたい、今後活用により研究加速を考えている/I would like to use AI and am considering accelerating my research through its use in the future. |
| 3-1 AI を活用することで推進したい(推進した)研究テーマを回答ください。(1テーマ40字程度)Please describe the research theme(s) you would like to promote (or have promoted) by utilizing AI. | AI駆動型成長因子FGF5–受容体FGFR1相互作用機構の解明 |
| 3-2 AIを活用することで解決したい(解決した)学術的課題の概要を教えてください(分野外の専門家がわかるように。1テーマ100〜300字程度)Please provide an overview of the academic challenge(s) you would like to address (or have addressed) by utilizing AI. | FGF5は細胞増殖を促す成長因子であり、FGFR1はそれを受け取る受容体タンパク質である。両者の結合は細胞機能の制御やがんの発症とも関連するが、複合体全体の立体構造、特に柔軟で形が一定しない無秩序領域(IDR)の構造と役割は十分に解明されていない。本研究では、クライオ電子顕微鏡解析に加えてAIによる構造予測を活用し、実験では可視化が困難な領域を補完することで、相互作用機構の全体像を明らかにする。 |
| 3-3 以下内容がわかる場合は具体的に教えてください。1.研究テーマで AI が特に有効または改善ができる部分はどこ(何)でしょうか?2.AIを活用することによって、研究分野にどのようなインパクトをあたえられるでしょうか?If possible, please provide specific details on the following points: 1Which part(s) ... | 1. FGF5–FGFR1複合体には柔軟な無秩序領域(IDR)が含まれ、クライオ電子顕微鏡ではその部分が平均化されて明瞭に観察できない可能性が高い。AIは配列情報や既存構造データを基に、これらの柔軟領域の構造アンサンブルや相互作用様式を予測できるため、実験で欠落しやすい部分を補完し、仮説形成を加速する点で特に有効である。
2. AIと実験構造解析を統合することで、従来「見えない」とされてきた柔軟領域の機能を構造的に議論できるようになる。本研究は、静的な構造決定にとどまらず、動的な分子相互作用を統合的に理解する新しい研究枠組みを提示するものであり、他の受容体複合体解析や創薬研究への展開も期待される。 |
| 3-4 現時点で AI for Science チャレンジ型に応募したいと思いますか?At this point, would you like to apply for the AI for Science Challenge–type program? | 共同研究先が見つかれば応募したい I would like to apply if a suitable collaborative research partner is found. |
| 3-5 ご自身の研究活動にAIを導入・活用するときの課題があれば教えてください。支援構築の参考にします。(複数選択可)If you have any challenges or concerns regarding the introduction or use of AI in your own research activities, please let us know. | 「チャレンジ型」公募に自分の研究が合うか判断できない I cannot determine whether my research is suitable for a “challenge-based” funding program.;相談できる相手がいない/AI専門研究者への伝手がない I do not have anyone to consult with / I have no connections to AI specialist researchers.;研究倫理や研究者としての倫理観等に不安がある(データ解析・2次利用・権利等その他関連事項) I have concerns about research ethics and professional ethics (e.g., data analysis, secondary use of data, intellectual property rights, and related issues).;データ整理・前処理が大変そう Data organization and preprocessing seem difficult and time-consuming.; |
| 3-6 上記テーマのためのデータは既に取得済みですか? Have the data for the above research theme already been collected? | 現在データはなく、これからデータを取得する予定(前向き研究)The data have not yet been collected, and we plan to collect them in the future (prospective research). |